MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida A449

Total Repeats: 16750

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009348	GCC	2	6	243645	243650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1002	NC_009348	CT	4	8	243729	243736	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1003	NC_009348	GCCT	2	8	243786	243793	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1004	NC_009348	GCC	2	6	245364	245369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1005	NC_009348	GGC	2	6	245376	245381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_009348	GTTG	2	8	245390	245397	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_009348	CA	3	6	245534	245539	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1008	NC_009348	TTTG	2	8	245551	245558	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_009348	GGT	2	6	248868	248873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_009348	GGC	2	6	248938	248943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_009348	TGT	2	6	249027	249032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_009348	GGT	2	6	249045	249050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_009348	GCC	2	6	249084	249089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1014	NC_009348	GGCC	2	8	250347	250354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1015	NC_009348	T	8	8	250462	250469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_009348	GTTT	2	8	250524	250531	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_009348	T	7	7	250529	250535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_009348	TAA	2	6	250592	250597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_009348	AGG	2	6	250657	250662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_009348	TTA	2	6	250761	250766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_009348	GA	3	6	253815	253820	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_009348	AGG	2	6	253825	253830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_009348	CCT	2	6	253837	253842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_009348	T	6	6	253842	253847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_009348	ATGG	2	8	253882	253889	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_009348	TTG	2	6	254671	254676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_009348	TGT	2	6	254702	254707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_009348	GCC	2	6	254735	254740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1029	NC_009348	CTG	2	6	256874	256879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_009348	TGCC	2	8	256927	256934	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_009348	GCC	2	6	256980	256985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1032	NC_009348	GCG	2	6	256991	256996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_009348	GAG	2	6	257006	257011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_009348	GCCCG	2	10	257045	257054	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1035	NC_009348	ATT	2	6	257055	257060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_009348	CAGGG	2	10	258486	258495	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1037	NC_009348	AGGG	2	8	258523	258530	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_009348	CCCT	2	8	258535	258542	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1039	NC_009348	GAC	2	6	259906	259911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_009348	AT	3	6	259917	259922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_009348	TC	4	8	259929	259936	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1042	NC_009348	AGG	2	6	259993	259998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_009348	TGCAC	2	10	260008	260017	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1044	NC_009348	TCC	2	6	260020	260025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_009348	A	7	7	260055	260061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_009348	TTG	2	6	260083	260088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_009348	AAAAG	2	10	260921	260930	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_009348	ATT	2	6	260944	260949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_009348	C	6	6	260961	260966	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1050	NC_009348	TGA	2	6	261969	261974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_009348	GAG	2	6	262087	262092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_009348	A	6	6	262909	262914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_009348	T	6	6	262957	262962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_009348	TGT	2	6	262978	262983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_009348	GCG	2	6	262995	263000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_009348	CAA	2	6	265615	265620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_009348	A	7	7	265674	265680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_009348	GGA	2	6	265701	265706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_009348	AG	3	6	265766	265771	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_009348	CT	3	6	265810	265815	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1061	NC_009348	CA	3	6	265829	265834	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_009348	CCTGA	2	10	265844	265853	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1063	NC_009348	CGC	2	6	265855	265860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1064	NC_009348	ATC	2	6	265884	265889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_009348	TTC	2	6	266923	266928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_009348	ATA	2	6	266958	266963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_009348	T	7	7	266981	266987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_009348	GCC	2	6	267505	267510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_009348	TCG	2	6	267514	267519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_009348	GAC	2	6	268362	268367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_009348	ATG	2	6	269061	269066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_009348	ACC	2	6	269149	269154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1073	NC_009348	TTGGG	2	10	270405	270414	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_009348	ACAT	2	8	270466	270473	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1075	NC_009348	TGT	2	6	270479	270484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_009348	TTG	2	6	270495	270500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_009348	AGG	2	6	270508	270513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_009348	TG	3	6	270585	270590	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_009348	CCT	2	6	270642	270647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1080	NC_009348	ACCC	2	8	270684	270691	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1081	NC_009348	ATG	2	6	270692	270697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_009348	ATT	2	6	273950	273955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_009348	AGT	2	6	274468	274473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_009348	AAAG	2	8	274483	274490	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_009348	G	7	7	274508	274514	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_009348	TG	4	8	274534	274541	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_009348	TCA	2	6	274546	274551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_009348	A	7	7	274586	274592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_009348	GAGT	2	8	274649	274656	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_009348	CTG	2	6	274684	274689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_009348	GTT	2	6	274795	274800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_009348	ATTC	2	8	276745	276752	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1093	NC_009348	TGGC	2	8	276761	276768	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1094	NC_009348	TGGG	2	8	277151	277158	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_009348	TGG	2	6	279332	279337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_009348	G	6	6	279372	279377	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_009348	ATAAG	2	10	279388	279397	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_009348	CAC	2	6	279892	279897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1099	NC_009348	A	6	6	279921	279926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_009348	TTG	2	6	279948	279953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_009348	GGC	2	6	283601	283606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_009348	TAG	3	9	283635	283643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_009348	AG	4	8	283646	283653	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_009348	AT	3	6	283703	283708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_009348	AATTT	2	10	283738	283747	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_009348	TCA	2	6	283795	283800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_009348	TA	3	6	283927	283932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_009348	GT	3	6	283956	283961	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_009348	CGC	2	6	285940	285945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_009348	TACTC	2	10	288052	288061	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1111	NC_009348	CAG	2	6	288062	288067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_009348	CGG	2	6	288101	288106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_009348	TCA	2	6	291174	291179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_009348	TGC	2	6	291232	291237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_009348	GAGT	2	8	291251	291258	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_009348	T	6	6	291261	291266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_009348	AAT	2	6	291281	291286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_009348	TGTC	2	8	291353	291360	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1119	NC_009348	AAC	2	6	291387	291392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_009348	CCA	2	6	291510	291515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1121	NC_009348	TGA	2	6	291594	291599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_009348	CT	3	6	291712	291717	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1123	NC_009348	CAT	2	6	291737	291742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_009348	ATAA	2	8	293000	293007	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_009348	GCC	2	6	293105	293110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1126	NC_009348	CTCGT	2	10	293123	293132	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1127	NC_009348	TTA	2	6	294172	294177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_009348	TTGG	2	8	295429	295436	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_009348	AGG	2	6	295463	295468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_009348	TCCT	2	8	295483	295490	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1131	NC_009348	TTCT	2	8	295524	295531	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1132	NC_009348	TGT	2	6	295565	295570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_009348	G	6	6	295578	295583	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_009348	GCTC	2	8	300803	300810	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1135	NC_009348	GCT	2	6	300841	300846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_009348	TCT	2	6	305197	305202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1137	NC_009348	GCT	2	6	305248	305253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1138	NC_009348	GAT	2	6	305288	305293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1140	NC_009348	A	7	7	305322	305328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1148	NC_009348	GGA	2	6	307796	307801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1149	NC_009348	TAAG	2	8	308228	308235	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1152	NC_009348	CTTTTT	2	12	312245	312256	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1153	NC_009348	TTCG	2	8	312855	312862	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1154	NC_009348	TGG	2	6	312877	312882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1161	NC_009348	TG	3	6	313120	313125	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1174	NC_009348	GAG	2	6	313734	313739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1263	NC_009348	T	6	6	318772	318777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1264	NC_009348	CT	3	6	318778	318783	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1265	NC_009348	GTTTT	2	10	319197	319206	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1267	NC_009348	CAA	2	6	319238	319243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1269	NC_009348	A	7	7	322471	322477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1270	NC_009348	TGC	2	6	322516	322521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1399	NC_009348	TAA	2	6	385364	385369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1401	NC_009348	GTC	2	6	385405	385410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1402	NC_009348	TCTA	2	8	385422	385429	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1403	NC_009348	TGCAG	2	10	385436	385445	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1404	NC_009348	ACC	2	6	385504	385509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1405	NC_009348	CAA	2	6	385530	385535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1406	NC_009348	CGA	2	6	385593	385598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1407	NC_009348	TGC	2	6	385599	385604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1408	NC_009348	ACA	2	6	385850	385855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1409	NC_009348	CGG	2	6	385863	385868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1410	NC_009348	CTG	2	6	385876	385881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1411	NC_009348	GGT	2	6	385888	385893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1412	NC_009348	CCA	2	6	385967	385972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1413	NC_009348	GCC	2	6	386014	386019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1414	NC_009348	CAA	2	6	386130	386135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1415	NC_009348	CAT	2	6	387413	387418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1416	NC_009348	TCCAAC	2	12	387495	387506	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
1417	NC_009348	CTG	2	6	387531	387536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1420	NC_009348	CCA	2	6	388960	388965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1422	NC_009348	ATG	2	6	391437	391442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1423	NC_009348	TCTG	2	8	394010	394017	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1424	NC_009348	ATG	2	6	394069	394074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1425	NC_009348	TGC	2	6	394109	394114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1426	NC_009348	TCT	2	6	394133	394138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1428	NC_009348	TGG	2	6	395796	395801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1429	NC_009348	TAAT	2	8	395818	395825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1430	NC_009348	CTG	2	6	399500	399505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1431	NC_009348	TTGT	2	8	399512	399519	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1432	NC_009348	TGT	2	6	399523	399528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1433	NC_009348	TA	3	6	408547	408552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1434	NC_009348	GA	3	6	410631	410636	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1435	NC_009348	GTTT	2	8	411809	411816	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1436	NC_009348	TC	3	6	412843	412848	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1437	NC_009348	TCAT	2	8	412864	412871	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1438	NC_009348	GATACC	3	18	412883	412900	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1439	NC_009348	CAGA	2	8	412954	412961	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1440	NC_009348	T	7	7	413874	413880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1441	NC_009348	TA	3	6	413906	413911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1442	NC_009348	GGC	2	6	416703	416708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1443	NC_009348	T	6	6	418377	418382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1444	NC_009348	GCCA	2	8	419330	419337	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1445	NC_009348	AACC	2	8	420866	420873	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1446	NC_009348	CGA	2	6	420973	420978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1447	NC_009348	GCC	2	6	420983	420988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1448	NC_009348	CAC	2	6	421004	421009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1449	NC_009348	ATG	2	6	421011	421016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1450	NC_009348	CAG	2	6	421025	421030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1451	NC_009348	ATC	2	6	421097	421102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1453	NC_009348	ATC	2	6	421125	421130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1464	NC_009348	ACC	2	6	421473	421478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1483	NC_009348	ATC	2	6	426191	426196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1487	NC_009348	CTG	2	6	426891	426896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1496	NC_009348	AT	3	6	432718	432723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1497	NC_009348	TCT	2	6	434176	434181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1499	NC_009348	T	7	7	434218	434224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1500	NC_009348	TGA	2	6	434230	434235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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